文山市婦女聯合會設3個內設機構。
1.綜合股。負責機關內部的綜合協調和服務;負責文電處理、會議組織、統計、財務、后勤服務等工作。
2.婦女權益科。負責法制宣傳,婦女兒童來信、來電和來訪接待;負責帶案下訪,以案釋法;負責參與社區做好家庭矛盾糾紛調解等工作。
3.婦女發展科。負責上級各類婦女發展項目、貸免扶補服務工作。